Kompetenčné centrum

Odborný garant: doc. RNDr. Roman Kuna, PhD.

Odborní pracovníci:

RNDr. Beáta Piršelová, PhD.
RNDr. Peter Boleček, PhD.
RNDr. Martin Galgóci, PhD.

TEMATICKÉ ZAMERANIE VÝSKUMU

Fyziológia rastlín v stresových podmienkach. Základný biologický výskum so zameraním na podstatu tolerancie rastlín voči rôznym nepriaznivým faktorom životného prostredia; s možnosťou jeho využitia v bioremediačných programoch. Laboratórium sa bude využívať vo výskumných oblastiach s tematikou bunkovej biológie, rastlinnej fyziológie, stresovej fyziológie rastlín, biochémie, analýzy zložiek životného prostredia. Prístrojové a profesijné vybavenie laboratória má umožniť detegovanie zmien v organizmoch na úrovni buniek a pletív vystavených rôznym nepriaznivým faktorom prostredia (sucho, ťažké kovy, nízka teplota, koncentrácia CO₂ apod.). Na základe rôznych súčasných a nových optimalizovaných metodík bude možné stanoviť mieru tolerancie voči rôznym kontaminantom a navrhnúť riešenia pre zvýšenie odolnosti rastlín. Najbežnejšie analýzy realizované v laboratóriách sú: stanovenie bežných rastových parametrov rastlín (čerstvá hmotnosť, sušina, listová plocha), stanovenie viability bunkových membrán, detekcia zmien v hladinách lipidovej peroxidácie membrán a taktiež detekcia reaktívnych foriem kyslíka, stanovenie koncentrácie fotosyntetických pigmentov a prolínu, merania parametrov fluorescencie chlorofylu, merania aktivity vybraných antioxidatívnych enzýmov). Mineralizácia vzoriek sa realizuje pre stanovenie vybraných zložiek životného prostredia (ťažké kovy, minerálne látky, atď.)

OBLASTI APLIKÁCIE VÝSLEDKOV VÝSKUMU

• Fytoremediácie
• Biotechnológie

VYBAVENIE LABORATÓRIA

• analyzátor ťažkých kovov EcaFlow 150 GLP,
• analyzátor fluorescencie chlorofylu FluorCam 1000-H,
• mineralizátor Ertec Magnum II,
• Fotometer Multiscan Spectrum
• Bunkový analyzátor
• Systém na fluorescenčnú analýzu buniek
• Rastová komora/Fytotron

REALIZOVANÉ PROJEKTY

2003 – 2005: ŠPVV -> 2003 SP 27/028 OD 01-01: Vplyv ťažkých kovov na fyziológiu a genotoxicitu vybraných druhov kultúrnych rastlín.
2005 – 2007: APVV -> APVT-51-004004: Genetická diverzita hybridných rojov Pinus mugo x Pinus sylvestris na Slovensku zisťovaná pomocou izoenzýmových molekulových markerov a chloroplastovej DNA.
2007 – 2009: VEGA -> 1/4370/07 Dekontaminácia pôd mobilizáciou ťažkých kovov využitím fytoremediácie.
2007 – 2009: VEGA -> 1/4354/07: Vybrané faktory ovplyvňujúce príjem a transport látok rastlinami využiteľnými vo fytotechnológiách.
2009 – 2012: VEGA -> 2/0076/09: Medzidruhové hybridy borovíc a jedlí na Slovensku, ich status a charakteristika.
2013 – 2015: VEGA -> 2/0057/13:Hybridné roje borovice lesnej a borovice horskej na Slovensku, genetický status a fertilita.

SPOLUPRÁCA

Akademická/vedecko-výskumná sféra

• NPPC-VÚRV, Piešťany, SR
• SPU v Nitre, Nitra, SR
• ÚGBR SAV Nitra, SR
• Výskumný ústav agroekológie (VÚA), Michalovce, SR
• Arborétum Mlyňany SAV, Vieska n. Žitavou, SR
• Přírodovědecká fak. UHK, Hradec Králové, ČR

 Prax

• Výskumno-šľachtiteľská stanica, Vígľaš-Pstruša, SR
• Výskumno-šľachtiteľská stanica, Malý Šariš, SR

FESZTEROVA,M. – JEDLOVSKA, L. 2014. The quality of sulphur selected fractions in soil from Nature reserve Žitavský Luh. In Acta fytotechnica et zootechnica. – ISSN 1336-9245, roč. 17, č.2 (2014), s.36-43.

Odborný garant: prof. RNDr. Klaudia Jomová, PhD.

Odborní pracovníci:

doc. Ing. Melánia Feszterová, PhD.
Mgr. Jana Braniša, PhD.
doc. Ing. Mária Porubská PhD.
Ing. Dominika Bončíková, PhD.

TEMATICKÉ ZAMERANIE VÝSKUMU

Analýza antioxidačných/prooxidačných vlastností prírodných látok, sledovanie príjmu a kumulácie toxických prvkov v živých organizmoch. Optimalizácia extrakcie prírodných látok z rastlinného materiálu, štúdium antioxidačných/prooxidačných vlastností prírodných látok a ich interakcia s redoxne aktívnymi kovmi, príprava komplexných zlúčenín prechodných prvkov s  rôznymi druhmi bioaktívnych organických ligandov, štúdium ich biologickej aktivity. Sledovanie príjmu a kumulácie rizikových a potenciálne toxických prvkov v živých organizmoch.  

OBLASTI APLIKÁCIE VÝSLEDKOV VÝSKUMU

• Potravinárstvo (bezpečnosť potravín)
• Farmakológia/medicína
• Poľnohospodárstvo

VYBAVENIE LABORATÓRIA

• stolný EPR spektrometer s príslušenstvom
• platničkový multifunkčný reader
• ultracentrifúga s príslušenstvom
• atómový absorpčný spektrofotometer s príslušenstvom

REALIZOVANÉ PROJEKTY

2011 – 2013: VEGA 1/0856/11 Spektroskopická analýa antioxidačných a prooxidačných vlastností karotenoidov.
2010 – 2014: APVV-0202-10 Poznanie elektrónovej štruktúry ako cesta k predikcii potenciálnych liečiv,
2010 – 2013: OPVaV -> 26220220110 – Environmentálne aspekty urbanizovaného prostredia
2008 – 2010: VEGA 1/0575/08 Syntéza, spektroskopické vlastnosti a biologická aktivita komplexných zlúčenín prechodných prvkov s SOD aktivitou
2007:RP MŠ SR - Dobudovanie integrovaného laboratória molekulárnych analýz

SPOLUPRÁCA

Akademická/vedecko-výskumná sféra

• Slovenská technická univerzita v Bratislave (Slovensko, SK)
• Slovenská poľnohospodárska univerzita v Nitre (Slovensko, SK)
• Liverpool John Moores University (Veľká Británia, UK)

Prax

• Biont, a.s. (Slovensko, SK)

Výstupy

PILKA,T. – PETROVICOVA,I. – KOLENA,B. – SIDLOVSKA,M. – MATEJOVICOVA,B. – VONDRAKOVA,M. Conection between phthalate exposure and beverages package material. In recenzovaný zborník z medzinárodnej vedeckej konferencie XII. Vedecká konferencia s medzinárodnou účasťou bezpečnosť a kontrola potravín, 26.-27.3.2015, Smolenice, Slovenská republika.

Odborný garant: doc. Ing. Ida Petrovičová, PhD.

Odborní pracovníci:

prof. RNDr. Mária Vondráková, CSc.
RNDr. Branislav Kolena, PhD.
RNDr. Martin Morovič, PhD.
RNDr. Barbora Matejovičová, PhD.
Mgr. Tomáš Pilka, PhD.

TEMATICKÉ ZAMERANIE VÝSKUMU

Determinácia vplyvu vybraných exogénnych a endogénnych faktorov na základné reprodukčné, morfologické a biomolekulárne parametre cicavcov a vývoj embryí v podmienkach in vitro. Dobudovanie špičkovej technologickej bázy pre výskum a vývoj v oblasti biotechnológií živočíchov. Realizácia výskumu na konkurencieschopnej úrovni a jeho prepojenie so vzdelávaním vysokoškolských študentov a absolventov. Analýza ftalátov ako potenciálnych endokrinných disruptorov v biologických matriciach, skríning fyziologických a somatometrických parametrov, so zohľadnením veku, pohlavia a ďalších aspektov. Kvalitatívna a kvantitatívna analýza aktivity epigenetických faktorov počas embryogenézy vybraných druhov cicavcov v stresových podmienkach.

Členovia nášho tímu majú skúsenosti so zberom a spracovaním biologických vzoriek ich analýzou prostredníctvom systému HPLC-MS/MS. Naše know-how a vybavenie ďalej umožňuje optimalizáciu a realizáciu metodík aj pre iné potenciálne toxické environmentálne polutanty.

• Certifikát kontroly kvality analýz

OBLASTI APLIKÁCIE VÝSLEDKOV VÝSKUMU

• Medicína (environmentálna toxikológia)
• Biotechnológie živočíchov

VYBAVENIE LABORATÓRIA

• HPLC and triplequad MS/MS
• Nano-HPLC s CHipCube a Q-TOF MS
• SPE automat

REALIZOVANÉ PROJEKTY

2012– 2015: VEGA -> 1/0042/12 – Analysis of selected environmental factors in relation to potential health risks
2011 – 2014: VEGA -> 1/0077/11 – Reprogramming of rDNA genome in embryos produced by interspecific nuclear transfer.
2010 – 2013: OPVaV -> 26220220110 - Environmental aspects of urban area
2008 – 2010: VEGA -> 1/0057/08 – Effect of bovine ooplasm on rDNA genome deactivation.
2006 – 2008: VEGA 1/3255/06-rDNA transcription re-activation in in vitro produced bovine embryos
2004 – 2005: RP MŠ SR -> 533 – Multifunctional laboratory of embryotechnology
2006 – 2010: 6RP -> 35468 - Training network on novel animal models for medical purposes

SPOLUPRÁCA

Akademická/vedecko-výskumná sféra

• Slovenská zdravotnícka univerzita v Bratislave (Slovensko, SK)
• Univerzita Komenského v Bratislave (Slovensko, SK)
• Masarykova Univerzita v Brně (Česká Republika, CZ)
• NPPC -Výskumný ústav živočíšnej výroby v Nitre (Slovensko, SK)
• Agricultural Biotechnology Institute in Gödöllő (Hungary, HU)

Výstupy

PERNIS,M. – STREJCEK,F. – DESHMUKH RAHUL,S. - ØSTRUP,O., VEJLSTED,M. – MOROVIC,M. – PAÁL,D. – NIEMANN,H. – LAURINCIK,J. – HYTTEL, P. a kol. Chromatin Dynamics Aberration in Embryos Produced by Parthenogenetic Activation. In editor Michal Hudec, Antal Csáky Scienta iuvenis: Book of Scientific Papers. – 1 ed. – Nitra: UKF, 2014. – ISBN 978-80-558-0650-1, CD-Rom, p.34-43.

M.MOROVIČ, F. STREJČEK, M.PERNIŠ, O. ØSTRUP, A.LUCAS-HAHN, B. PETERSEN, H.NIEMANN, P. HYTTEL, J.LAURINČÍK. The Influence of the Ooplasm on DNMT1 and DNMT3A Gene Expression. National Agricultural and food centre: Slovak J. Anim. Sci., 48,2015 (1), ISSN 1337-9984, p. 37-42.

Odborný garant: doc. RNDr. František Strejček, PhD.

Odborní pracovníci:

RNDr. Martin Morovič, PhD.
RNDr. Patrik Meszáros, PhD.
Mgr. Miroslav Perniš, PhD.

Konzultant: prof. h. c. prof. Dr. MVDr. Jozef Laurinčík, DrSc.

TEMATICKÉ ZAMERANIE VÝSKUMU

Podmienky kultivácie embryí sú ovplyvnené rôznymi endogénnymi a exogénnymi faktormi (chemické, fyzikálne), ktoré následne vplývajú na ich základné reprodukčné a morfologické parametre. Výskumná oblasť je zameraná na produkciu embryí v podmienkach in vitro za účelom zvýšenia počtu markerov vhodných pre hodnotenie kvality embryí používaných v biomedicínskom výskume. Cieľom je dobudovanie špičkovej technologickej bázy pre výskum a vývoj v oblasti biotechnológií - embryotechnológií za účelom objasnenia vplyvu vybraných exogénnych a endogénnych faktorov na ranú embryogenézu ako aj na základné reprodukčné a morfologické parametre živočíchov.

Rozpracovanie metód za účelom mapovanie procesov prebiehajúcich počas raného embryonálneho vývinu cicavcov na úrovni molekulárnej a ultraštrukturálnej (imunocytochémia - lokalizácia enzýmov, proteínov a rôznych faktorov v rámci bunky, jadra resp. jadierka) získaných in vivo, in vitro a tieto poznatky preniesť do procesu vzdelávania. Riešiteľský kolektív počas posledného desaťročia dosiahol svetovo uznávané výsledky v oblasti štúdia nukleologenézy a reaktivácie genómu včasných embryí cicavcov. Jeho medzinárodná akceptácia je doložená ako medzinárodnou spoluprácou tak aj participovanim na viacerých projektoch v zahraničí.

OBLASTI APLIKÁCIE VÝSLEDKOV VÝSKUMU

• Imunocytochemická detekcia proteínov/enzýmov
• Hodnotenie kvality oocytov/embryí

VYBAVENIE LABORATÓRIA

•  Konfokálny mikroskop s mikromanipulačnou jednotkou

REALIZOVANÉ PROJEKTY

2011 – 2014: VEGA -> 1/0077/11 - Reprogramovanie rDNA genómu embryí vytvorených medzidruhovým prenosom jadra
2008 – 2010: VEGA -> 1/0057/08 - Vplyv ooplazmy hovädzieho dobytka na deaktiváciu genómu rDNA.
2007- 2009: VEGA -> 1/4323/07 - Štúdium transkripcie rDNA embryí produkovaných in vitro
2006 – 2008: VEGA -> 1/3255/06 - Reaktivácia rDNA transkripcie včasných embryí hovädzieho dobytka produkovaných in vitro
2005 – 2007: VEGA -> 1/2327/05 - Nukleologenéza a reaktivácia rDNA transkripcie embryí ošípaných in vivo a po prenose jadier.
2004 – 2006: VEGA -> 1/1270/04 - Genes activation in early porcine embryos developed in vivo or in vitro
2006 – 2009: APVV -> LPP-0018-06 - Štúdium transkripcie rDNA embryí produkovaných in vitro
2006 – 2010: 6RP -> 35468 - Training network on novel animal models for medical purposes
2008 – 2009: VTS -> NATO/UKF/08 - Štúdium markerov transkripcie rDNA včasných embryí produkovaných in vitro
2005 – 2006: NATO -> CBP.EAP.CLG.981248 - rDNA transcription re-activation in vitro
2005 – 2006: VTS -> DAAD-PPP - Nucleologenesis and the rRNA genome re-activation in early porcine embryos
2005 – 2007: KEGA -> 3/3132/05 - Produkcia in vitro embryí – virtuálne laboratórium

SPOLUPRÁCA

Akademická/vedecko-výskumná sféra

• Institute of Animal Science (FAL), Mariensee, Nemecko
• Kodaňská Univerzita, Frederiksberg C, Dánsko
• VUŽV, Praha Uříněves, Česká republika

Výstupy

CHOVANCOVA,H. - OMELKA,R. - BOBONOVA,I. - FORMICKI R.T. - MARTINIAKOVA,M. Bone Adaptation to Simaltaneous Cadmium and Diazinon Toxicity in Adult Male Rats. In Potravinárstvo, vol.8, 2014, no.1. - ISSN 1337-0960 (online), s. 107-113.

MARTINIAKOVA, M. – BOBONOVA,I. – OMELKA,R. – DURANOVA,H. – BABOSOVA,R. – STAWARZ,R. – TAMAN,R. Low Administration of Bee Pollen in the Diet Affect Bone Microstructure in Male Rats. In Potravinárstvo, vol.8, no.1. - ISSN 1337-0960 (online), s. 277-283.

ADAMKOVICOVA,M. – TOMAN,R. – CABAJ,M. – MASSANYI,P. – MARTINIAKOVA,M. – OMELKA,R. – KRAJCOVICOVA,V. – DURANOVA,H. Effect of Subchronic Exposure to Cadmium and Diazinon on Testis and Epididyms in Rats. In HINDAWI The Scientific World Journal, vol.2014, article ID 632581, 9 pages.

Odborný garant: prof. RNDr. Radoslav Omelka, PhD.

Odborní pracovníci:

prof. RNDr. Mária Bauerová, PhD.
prof. RNDr. Monika Martiniaková, PhD.
RNDr. Vladimíra Krajčovičová, PhD.
Ing. Mária Adamkovičová, PhD.

TEMATICKÉ ZAMERANIE VÝSKUMU

Genetická variabilita vo vzťahu k významným znakom a vlastnostiam živočíchov a človeka. Biológia kosti, kostného tkaniva a ochorení postihujúcich kosti. Realizácia výskumu na medzinárodne akceptovanej úrovni v úzkom prepojení na vzdelávanie v oblasti molekulárnej biológie, genetiky, morfológie a toxikológie živočíchov a človeka.

Vybavenie laboratória umožňuje detegovať genetickú variabilitu a biodiverzitu organizmov, realizovať pokročilé genomické štúdie spoločne s veľmi presným hodnotením morfologicko-fyziologických parametrov, ako aj štúdium odpovede a rezistencie organizmu na rizikové faktory prostredia alebo predikciu genetického rizika vzniku ochorení. Na tento účel využívame moderné technológie detekcie genetickej variability vrátane sekvenovania novej generácie, analýzy aktivity génov vrátane microarrays, kultivácie a analýzy buniek a štrukturálnej analýzy vrátane 3D zobrazenia počítačovou tomografiou.

OBLASTI APLIKÁCIE VÝSLEDKOV VÝSKUMU

• Šľachtenie hospodárskych zvierat
• Medicína
• Toxikológia
• Štúdium biodiverzity

VYBAVENIE LABORATÓRIA

• Genetický analyzátor pre sekvenovanie novej generácie
• Mikro CT skener
• Microarray skener
• Genetický analyzátor
• Real-time PCR systém
• Real-time bunkový analyzačný systém
• Mikrotóm na tvrdé spojivové tkanivá

REALIZOVANÉ PROJEKTY

2010 – 2013: ŠF EÚ - OPVaV, ITMS 26220120042 - Centrum excelentnosti pre výskum genetických živočíšnych zdrojov
2009 – 2012: ŠF EÚ - OPVaV, ITMS 26220220033 - Výskum genetických markerov a ich aplikácia pri šľachtení a ochrane genofondu hospodárskych zvierat
2009 – 2011: ŠF EÚ - OPVaV, ITMS 26220120051 - Laboratórium šľachtenia, výpočtovej genetiky a výskumu genetických živočíšnych zdrojov
2013 – 2014: ASO 2013-03-15-0001 - Štrukturálna analýza kostí u podoplanin-deficientných myší
2011 – 2013: VEGA - 1/0790/11 - Toxické aspekty mykotoxínov na živočíšne bunky in vitro
2006 – 2008: VEGA 1/3539/06 - Analýza genetických polymorfizmov v génoch pre prolaktínový receptor a retinol viažúci proteín 4 vo vzťahu k reprodukčným vlastnostiam vybraných plemien ošípaných chovaných na Slovensku
2006 – 2007: ASO SK-05/06-BA-016 - Aplikácia technológie microarray vo výskume osteoporózy
2000 – 2002: VEGA 1/7004/20 - Analýza genetického polymorfizmu estrogénového receptora vo vzťahu ku plodnosti ošípanej

SPOLUPRÁCA

Akademická/vedecko-výskumná sféra

• SPU v Nitre, Slovensko
• NPPC - VÚŽV Nitra, Slovensko
• Pedagogická univerzita Krakow, Poľsko
• Georg-Augustova univerzita Göttingen, Nemecko
• Mendelova univerzita v Brne, Česká republika
• Lekárska univerzita vo Viedni, Rakúsko

Prax

• Zväz chovateľov oviec a kôz na Slovensku, Slovensko
• Súkromná ortopedická ambulancia, Nitra, Slovensko

Výstupy