Rigorózne konanie na FPVaI sa vykonáva v zmysle ustanovení zákona č. 131/2002 o vysokých školách.
Absolventi študijných programov, ktorí získali titul "magister" môžu vykonať rigoróznu skúšku, ktorej súčasťou je aj obhajoba rigoróznej práce.
Uchádzač si podáva žiadosť o vykonanie rigoróznej skúšky v odbore, v ktorom získal vysokoškolské vzdelanie alebo v príbuznom študijnom odbore.
V rozhodovaní o začatí rigorózneho konania sa zohľadňujú aktivity uchádzača v danom odbore (publikačná činnosť, riešenie projektov, vystúpenia na konferenciách a pod.).
Fakulta prírodných vied uskutočňuje rigorózne konanie a udeľuje akademický titul "doktor prírodných vied" (v skratke "RNDr.") v študijných odboroch:
prof. RNDr. Michal Munk, PhD.
- Automatická evalvácia strojového prekladu
- Predspracovanie dát v procese získavania vzorov správania sa používateľov webu
- Modelovanie správania sa stakeholderov komerčnej banky
prof. Ing. Milan Turčáni, CSc.
- Mobilné technológie a ich Cloudové možnosti pri zvyšovaní atraktivity prírodovedného vzdelávania
doc. Ing. Zoltán Balogh, PhD.
- Modelovanie vzdelávacích procesov pomocou IF THEN pravidiel a fuzzy Petriho sietí v LMS (RNDr.)
- Modelovanie komunikácie v počítačovej sieti pomocou Petriho sietí (RNDr.)
doc. PaedDr. Jozef Kapusta, PhD.
- Identifikácia falošných správ pomocou neurónových sietí
- Objavovanie vzťahov z neštruktúrovaných údajov pomocou metód spracovania prirodzeného jazyka
V študijnom odbore Učiteľstvo akademických predmetov fakulta uskutočňuje rigorózne konanie a udeľuje akademický titul "doktor pedagogiky" (v skratke "PaedDr.") v študijných programoch:
Témy rigoróznych prác v študijnom odbore 38. Učiteľstvo a pedagogické vedy - biológia (PaedDr.) je možné dohodnúť aj individuálne na osobnej konzultácii s vyučujúcimi na KBG FPV UKF v Nitre (so zameraním na botaniku, genetiku alebo fyziológiu rastlín), ako aj na KZA FPV UKF v Nitre (témy so zameraním na zoológiu, antropológiu, histológiu živočíchov, fyziológiu živočíchov, didaktiku biológie a i.).

V študijnom odbore Učiteľstvo profesijných predmetov a praktickej prípravy fakulta uskutočňuje rigorózne konanie a udeľuje akademický titul "doktor pedagogiky" (v skratke "PaedDr.") v študijnom programe:
- Využitie projektového vyučovania vo výučbe odborných ekonomických predmetov
- Tvorba a vyhodnocovanie testov vo výučbe ekonomických predmetov
- Inovatívne metódy vo vyučovaní ekonomických predmetov
- Výpočtovou technikou a špecializovaným softvérom podporované vyučovanie ekonomických predmetov
- Komparácia efektívnosti výučby ekonomických predmetov s využitím skupinového a klasického vyučovania.